Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH3O43739 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH3O43739 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms