Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATCO43716 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATCO43716 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATCO43716 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATCO43716 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATCO43716 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATCO43716 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATCO43716 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATCO43716 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATCO43716 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATCO43716 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATCO43716 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATCO43716 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
GATCO43716 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms