Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms