Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNF13O43567 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF13O43567 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF13O43567 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF13O43567 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF13O43567 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF13O43567 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF13O43567 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNF13O43567 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF13O43567 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF13O43567 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF13O43567 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms