Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINT1O43278 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms