Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD3O43242 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD3O43242 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms