Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRXO43186 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CRXO43186 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRXO43186 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRXO43186 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRXO43186 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRXO43186 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CRXO43186 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRXO43186 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CRXO43186 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms