Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD3EAPO15446 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD3EAPO15446 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms