Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP290O15078 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP290O15078 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP290O15078 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP290O15078 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP290O15078 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP290O15078 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP290O15078 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP290O15078 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP290O15078 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP290O15078 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP290O15078 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP290O15078 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP290O15078 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms