Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ2O15056 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SYNJ2O15056 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SYNJ2O15056 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms