Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VCYO14598 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VCYO14598 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VCYO14598 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VCYO14598 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VCYO14598 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VCYO14598 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VCYO14598 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VCYO14598 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VCYO14598 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VCYO14598 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VCYO14598 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCYO14598 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCYO14598 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VCYO14598 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms