Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TXNDC9O14530 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TXNDC9O14530 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms