Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRTO14522 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRTO14522 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
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