Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PES1O00541 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PES1O00541 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PES1O00541 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PES1O00541 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PES1O00541 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PES1O00541 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PES1O00541 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PES1O00541 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PES1O00541 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PES1O00541 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PES1O00541 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PES1O00541 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PES1O00541 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PES1O00541 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PES1O00541 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PES1O00541 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PES1O00541 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PES1O00541 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms