Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
O00370 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
O00370 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
O00370 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
O00370 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
O00370 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
O00370 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
O00370 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
O00370 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
O00370 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
O00370 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
O00370 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
O00370 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
O00370 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
O00370 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
O00370 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
O00370 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
O00370 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
O00370 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
O00370 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
O00370 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
O00370 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms