Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3CDO00329 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CDO00329 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms