Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4O00268 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4O00268 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4O00268 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4O00268 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4O00268 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4O00268 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4O00268 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4O00268 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF4O00268 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAF4O00268 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAF4O00268 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms