Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARVCFO00192 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARVCFO00192 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARVCFO00192 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms