Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQV1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQV1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQV1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQV1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H3BQV1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H3BQV1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H3BQV1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H3BQV1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H3BQV1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BQV1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BQV1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BQV1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BQV1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BQV1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H3BQV1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H3BQV1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H3BQV1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H3BQV1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BQV1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BQV1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BQV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BQV1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BQV1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BQV1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BQV1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BQV1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BQV1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BQV1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms