Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PATL2C9JE40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms