Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN25C9JDP6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN25C9JDP6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms