Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF879B4DU55 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF879B4DU55 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms