Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALM2-AKAP2B1ALY0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms