Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms