Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYSRT1A8MQ03 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYSRT1A8MQ03 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms