Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00473A8K010 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00473A8K010 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms