Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YJEFN3A6XGL0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YJEFN3A6XGL0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YJEFN3A6XGL0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms