Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD3A6NKT7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD3A6NKT7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms