Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF233A6NK53 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF233A6NK53 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF233A6NK53 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms