Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6BA6NDN3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6BA6NDN3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms