Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL33A6NCF5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms