Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC162PA2VCL2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC162PA2VCL2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms