Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX2A2RU54 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMX2A2RU54 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms