Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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