Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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