Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A087X1B8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A087X1B8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087X1B8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087X1B8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A087X1B8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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