Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HERC3Q15034 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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