Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NBR1Q14596 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NBR1Q14596 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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NBR1Q14596 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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NBR1Q14596 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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