Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCAMP50895 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCAMP50895 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BCAMP50895 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms