Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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USP35Q9P2H5 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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USP35Q9P2H5 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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USP35Q9P2H5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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USP35Q9P2H5 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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