Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AP001360.1-201ENST00000534055 518 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MIA-203ENST00000594436 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NIPA2P4-201ENST00000523928 1341 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RN7SL292P-201ENST00000473305 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms