Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DEFB1P60022 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DEFB1P60022 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms