Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MAGEA9B-203ENST00000595065 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 VN1R64P-201ENST00000424940 933 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL121761.1-203ENST00000426012 677 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 C12orf71-201ENST00000429849 957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PRDX2P2-201ENST00000451920 587 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SNCA-208ENST00000505199 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 BIN3-210ENST00000522268 321 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RPSAP71-201ENST00000522496 872 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LINC00592-201ENST00000549830 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PTOV1-AS2-201ENST00000593654 596 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL078590.3-201ENST00000607531 750 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LINC00963-211ENST00000608369 961 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LINC00222-207ENST00000448744 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TBP-201ENST00000230354 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TRERNA1-201ENST00000431460 462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CIDECP-205ENST00000433871 770 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC074351.1-201ENST00000439413 481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC007923.4-201ENST00000578650 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC004702.1-201ENST00000580225 195 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL157791.2-201ENST00000604758 478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ABHD11-AS1-202ENST00000641969 358 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC240565.1-201ENST00000624936 1373 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TIRAP-201ENST00000392678 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 NPIPB2-202ENST00000399147 1194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL353747.1-201ENST00000404577 267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC092431.1-201ENST00000415342 420 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HUNK-AS1-201ENST00000437109 616 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AP000695.2-202ENST00000454980 649 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ACRBP-204ENST00000536350 1053 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SNHG15-209ENST00000584686 541 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FAM236A-202ENST00000611003 403 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL353626.2-201ENST00000615372 130 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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