Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms