Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DCLRE1C-208ENST00000378258 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms