Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRAF6Q9Y4K3 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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