Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRMT13Q9NUP7 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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