Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CGNL1Q0VF96 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms