Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM6Q9C030 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM6Q9C030 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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