Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms